通州是我国历史上的一个著名地名，现在北京市及江苏南通市也各有一个通州区，历史上曾有“南北通州”之说，两个通州曾有近千年时间并置，新中国时期也曾都设为县级通州市，现在仍有同名的北京市、南通市两个通州区。

南北通州历史均颇为悠久，北通州现为北京市通州区，其建制时间要早于南通州，但设为通州要晚于南通州，而南通州演变为了今江苏省南通市，南通市曾代管县级通州市，现为南通市通州区。

北京市通州区为京杭大运河北端，其境古属燕国，秦代为渔阳郡之地，西汉时就已置县称路县，有两千年建制史，而此时的南通还为长江口海域中的沙洲，南北朝时期才逐渐成陆，唐朝时才开始跟大陆相连，由此来看北通州历史要比南通州久远的多。

路县隶属于渔阳郡，到东汉时改称潞县，仍为渔阳郡所辖。南北朝时期建制变迁频繁，隋唐时曾为渔阳郡、幽州、涿郡、玄州、范阳郡等所辖，其中唐初短暂为玄州治。契丹兴起后，潞县为辽国之地，隶属于析津府，金代天德三年（1151年）于潞县设州，“取漕运通济之义”取名通州，由于此时南宋已有通州（今南通）俗称“北通州”。

南通南北朝逐渐成立后就已有人定居煮盐为业，唐末与大陆相连后人烟逐渐稠密并逐渐形成市镇，五代时为静海镇，后周显德五年（958年）建通州，以其东北有大海通辽海诸夷、西南有长江连吴越楚蜀、内运渠道达齐鲁燕冀而得名，静海镇也改设为静海县，为通州治所。此后过了近百年，北通州才设立，此通州便俗称“南通州”，两个通州曾并存近千年，下文分别称其为南、北通州。

两宋时，南通州曾短暂改称崇州，一直隶属于淮南东路，元朝时隶属于河南江北行省扬州路，也曾短暂为通州路，而北通州为“腹里”大都路所辖。明初，潞县、静海县分别省入北、南通州，北通州先后为北平府、顺天府所辖散州，领本辖（原潞县地）及三河、武清、香河、县等四县，南通州隶属于扬州府，领本辖（原静海县）及海门一县（明初还曾领有崇明县，洪武九年改隶苏州府）。

清初，县省入北通州，到雍正时北通州不再领县仍隶属于顺天府，南通州升为直隶州，直隶于江苏省。民国初废州为县，南北通州分别改称南通县、通县。1948年通县解放后曾以县城设通州市，1949年改为县级通县镇，1949年4月南通县解放后以县城置县级南通市，市、县开始分置。

新中国成立时，河北省有通县专区，县级通县镇、通县为其所辖，苏北行署区有南通专区，县级通州市、南通县为区所辖。1953年通县镇改为县级通州市，仍隶属于通县专区且为其驻地，1958年通县专区撤销，县级通州市、通县划归北京市并合并为北京市通州区，1960年复为北京市通县，1997年撤县再次设北京市通州区。

1950年，南通市升为苏北行署区直辖市，但仍为南通专区驻地。1953年苏南、苏北两行署区合并设江苏省，南通市仍为省辖市，南通专区仍驻南通市且辖南通县。1983年江苏省施行市管县体制，南通地区撤销，南通县划归地级南通市管辖，1993年南通县改为县级通州市，2009年县级南通市撤销设为南通市通州区。